RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049908.10

Ssbp4-201, Transcript of Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ssbp4, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 WwoxQ91WL8 414 aa20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Mrgpra2Q91WW4 305 aa20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cngb3Q9JJZ9 694 aa20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kcne5Q9QZ26 143 aa20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 ReckQ9Z0J1 971 aa20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ern2Q9Z2E3 911 aa20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Apba1B2RUJ5 842 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 2310061I04RikB8JJ69 315 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr319L7MTY4 306 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr603L7N1Y4 312 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ech1O35459 327 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cyp2a12P56593 492 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Slc17a7Q3TXX4 560 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Taok1Q5F2E8 1001 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cage1Q5IR70 849 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 SnupnQ80W37 358 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 NapepldQ8BH82 396 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Elmo2Q8BHL5 732 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Gramd4Q8CB44 633 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 TwnkQ8CIW5 685 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 FbrsQ8R089 466 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr695Q8VFM3 315 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr535Q8VGL3 312 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Krt7Q9DCV7 457 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Lgals8Q9JL15 316 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Bod1lE9Q6J5 3032 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 AcacbE9Q4Z2 2448 aa20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Btnl6A2CG22 539 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Lilra5D3Z7A9 295 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Obox5G3X9P6 291 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Hcn2O88703 863 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kcnj9P48543 393 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Riiad1Q3KNY5 119 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 VwceQ3U515 929 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ephx4Q6IE26 359 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr1037Q7TR84 321 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Hsfy2Q80Y37 392 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Adamts4Q8BNJ2 833 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Tmem120aQ8C1E7 343 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Fam221aQ8C790 301 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Acot2Q9QYR9 453 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Carm1Q9WVG6 608 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Psmd13Q9WVJ2 376 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 GghQ9Z0L8 317 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Bcat2O35855 393 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rfc1P35601 1131 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Tango2P54797 276 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Glp2rQ5IXF8 512 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Havcr1Q5QNS5 305 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 E2f1Q61501 430 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 ManealQ6P1J0 452 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 PolnQ7TQ07 864 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Vrk1Q80X41 440 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ubp1Q811S7 540 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Zfp57Q8C6P8 421 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 AadacQ99PG0 398 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 RtcAQ9D7H3 366 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 EcsitQ9QZH6 435 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Aldh18a1Q9Z110 795 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cpne6Q9Z140 557 aa20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Zfp407G3UVV3 2246 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rnf169E9Q7F2 694 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Gm42641I6L9G2 585 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 AgxtO35423 414 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Krt8P11679 490 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 CblP22682 913 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cd59bP58019 129 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 F8a1Q00558 380 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Kcnh6Q32ME0 950 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Timm8a2Q4FZG7 97 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Gstm7Q80W21 218 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 TtpaQ8BWP5 278 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Clip4Q8CI96 704 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Acap1Q8K2H4 740 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Olfr353Q8VGK0 311 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 D730048I06RikQ9CQB8 106 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Cst9Q9Z0H6 137 aa20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Col4a2P08122 1707 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Serpinb3cA2RSF9 386 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Lrrc31F6VYM1 502 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Gm21976J3QNN2 249 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Vmn2r2L7N2E9 908 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Vps26aP40336 327 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Plin2P43883 425 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 ptchd1Q14B62 888 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Sec24dQ6NXL1 1032 aa20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4-201ENSMUST00000049908 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.6 ms