RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chchd4Q8VEA4 139 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AcadsbQ9DBL1 432 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phc2Q9QWH1 850 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DguokQ9QX60 277 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4450E9Q007 373 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Herc6F2Z461 1003 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LifP09056 203 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ido1P28776 407 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Yap1P46938 488 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ext2P70428 718 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Emx2Q04744 253 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt2Q3TTY5 707 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CenplQ3U3S3 329 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hsd3b4Q61767 373 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Enpp3Q6DYE8 874 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pik3c3Q6PF93 887 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Amigo2Q80ZD9 519 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim31Q8R0K2 507 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Moxd1Q9CXI3 613 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 9030624G23RikQ9D308 155 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TrmuQ9DAT5 417 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NfkbizQ9EST8 728 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akr1a1Q9JII6 325 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ncor1Q60974 2453 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf165E9QAU8 347 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fth1P09528 182 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 S100a9P31725 113 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgap39P59281 1107 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PhexP70669 749 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 InhbbQ04999 411 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 StradaQ3UUJ4 431 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpc1Q61056 793 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 InavaQ7TN12 663 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rap2aQ80ZJ1 183 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smad3Q8BUN5 425 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Piwil2Q8CDG1 971 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acap1Q8K2H4 740 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ntmt1Q8R2U4 223 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slco1a5Q91YY5 670 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TrilQ9DBY4 809 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myg1Q9JK81 380 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prokr1Q9JKL1 393 aa20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm12695A2AGB2 545 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm17175E9Q528 179 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh3pxd2aO89032 1124 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01810 119 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 JundP15066 341 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pim3P58750 326 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnab3P97382 249 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Parp8Q3UD82 852 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifi47Q61635 420 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Casd1Q7TN73 797 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgef38Q80VK6 770 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf410Q8BKX7 478 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chst8Q8BQ86 417 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cars2Q8BYM8 551 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rgs18Q99PG4 235 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efhc2Q9D485 750 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phf10Q9D8M7 497 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PcntP48725 2898 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ces2hF6Z9B9 558 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhox2hK7N6P1 191 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il11ra2P70225 432 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdkl4Q3TZA2 342 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxr1Q3UTB7 268 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MlipQ5FW52 269 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nrg1Q6DR99 700 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr667Q7TRP4 326 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Guca1bQ8VBV8 201 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr846Q8VET8 312 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Syt17Q920M7 470 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp2r2dQ925E7 453 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmp1Q99KU0 406 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Haus5Q9D786 619 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dhx34Q9DBV3 1145 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hmg20aQ9DC33 346 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B9d1Q9R1S0 204 aa20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smok4aA0JLX3 433 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20431E9PY39 371 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr50O88495 591 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klf10O89091 479 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01665 111 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01666 111 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Agtr2P35374 363 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 EpycP70186 322 aa20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itgb8Q0VBD0 767 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms