RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637053.1

VIM-210, Transcript of vimentin, humanhuman

TSL 2

Gene VIM, Length 508 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-210ENST00000637053 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 NR5A2O00482 541 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 SCDO00767 359 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 MDM4O15151 490 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 LDLRAD4O15165 306 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 CHADO15335 359 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 INPPL1O15357 1258 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 KCNN4O15554 427 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 ZNF264O43296 627 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 PPIP5K2O43314 1243 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 DCXO43602 365 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 ECE2O60344 883 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 CABYRO75952 493 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 DDNO94850 711 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 KAT7O95251 611 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 BMP10O95393 424 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 AHSA1O95433 338 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 NSA2O95478 260 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 C1SP09871 688 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 UCP1P25874 307 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 HLA-FP30511 346 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 LRPAP1P30533 357 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 GCKP35557 465 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 CDKN1AP38936 164 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 CASRP41180 1078 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 PER3P56645 1201 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 UFM1P61960 85 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 B4GALNT1Q00973 533 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 GLO1Q04760 184 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 LRRC63Q05C16 580 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 SPOCK1Q08629 439 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 IFI44LQ53G44 452 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 XKR4Q5GH76 650 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 CDKL4Q5MAI5 379 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 MLIPQ5VWP3 458 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 LRRC66Q68CR7 880 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 SLC25A25Q6KCM7 469 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 C1orf94Q6P1W5 598 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 FAM122BQ7Z309 247 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 VTCN1Q7Z7D3 282 aa2.95□□□□□ -1.94
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VIM-210ENST00000637053 ZNF677Q86XU0 584 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 PLCZ1Q86YW0 608 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 RHOT1Q8IXI2 618 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 C10orf67Q8IYJ2 551 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 ZBTB2Q8N680 514 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 FADS6Q8N9I5 356 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 OR5T1Q8NG75 326 aa2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
VIM-210ENST00000637053 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.95□□□□□ -1.94
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