RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	PGR	P06401	933 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	IGFBP5	P24593	272 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KIR3DL1	P43629	444 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC22A12	Q96S37	553 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	DYRK4	Q9NR20	520 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PCTP	Q9UKL6	214 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ANGPTL1	O95841	491 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAM17	P78536	824 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HPCA	P84074	193 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	DAG1	Q14118	895 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM199	Q8N511	208 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX6	Q9UNH7	406 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	NIN	Q8N4C6	2090 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	FPGT	O14772	594 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	BCKDK	O14874	412 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXA2	O43364	376 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	B3GALT4	O96024	378 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	EPOR	P19235	508 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SPAM1	P38567	509 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TRPC1	P48995	793 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB39A	Q14964	217 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	STX19	Q8N4C7	294 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	AIG1	Q9NVV5	245 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	VAPA	Q9P0L0	249 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	VILL	O15195	856 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KLKB1	P03952	638 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP11A1	P05108	521 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SMIM18	P0DKX4	95 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CYBA	P13498	195 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PREP	P48147	710 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PROSER1	Q86XN7	944 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2T11	Q8NH01	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	WBP2	Q969T9	261 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF599	Q96NL3	588 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PTPRF	P10586	1907 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		H3BN98	237 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		K7EPI3	171 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TRBC1	P01850	177 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MMP2	P08253	660 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNAB2	Q13303	367 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CD200R1	Q8TD46	325 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	FRS2	Q8WU20	508 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HTRA1	Q92743	480 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	EGLN2	Q96KS0	407 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT84	Q9NSB2	600 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf109	Q9NX04	203 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PDE10A	Q9Y233	779 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		12.5	□□□□□ -0.41

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