RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614136.1

SRSF3-205, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 3, human

Gene SRSF3, Length 2,376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF3-205	ENST00000614136	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136		M0R296	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TM9SF1	O15321	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	EFS	O43281	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SGTA	O43765	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZBTB14	O43829	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	VEGFD	O43915	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	NUAK1	O60285	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GLRA3	O75311	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	COL6A2	P12110	1019 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	HTR1B	P28222	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PDHA2	P29803	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	IGFALS	P35858	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ETV4	P43268	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	THOP1	P52888	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ACAP2	Q15057	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	INSC	Q1MX18	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KLC3	Q6P597	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ISL2	Q96A47	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136		A0A087X1B8	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136		B2RBV5	119 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CDC7	O00311	574 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	BTN3A1	O00481	513 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GRID2	O43424	1007 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GUCA1C	O95843	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FTH1	P02794	183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	APOA4	P06727	396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CEACAM5	P06731	702 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CPA3	P15088	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CD1D	P15813	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TFEB	P19484	476 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CD33	P20138	364 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	DGKA	P23743	735 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	AOAH	P28039	575 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	AKT2	P31751	481 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC26A3	P40879	764 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MAGEA12	P43365	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MASP1	P48740	699 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FNTB	P49356	437 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RGS4	P49798	205 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CSRP3	P50461	194 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC18A1	P54219	525 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	IL9R	Q01113	521 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PLAUR	Q03405	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ABR	Q12979	859 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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