RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 KCND1Q9NSA2 647 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 AMACRQ9UHK6 382 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF711Q9Y462 761 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 OR5K3A6NET4 321 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 F5H423 210 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 KCNK1O00180 336 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 AURKAO14965 403 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 VEGFDO43915 354 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 LCA5LO95447 670 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 GZMAP12544 262 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CCNCP24863 283 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 RORAP35398 523 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 HALP42357 657 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 RIPPLY3P57055 190 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 GBE1Q04446 702 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CDK18Q07002 472 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ZBTB17Q13105 803 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CDK5R2Q13319 367 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 DPYSL3Q14195 570 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ASIC2Q16515 512 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 RPE65Q16518 533 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 MED25Q71SY5 747 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 HPS6Q86YV9 775 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 DSELQ8IZU8 1212 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CNTD1Q8N815 330 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 FAM71BQ8TC56 605 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CD180Q99467 661 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 TLR10Q9BXR5 811 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 NLNQ9BYT8 704 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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TTR-204ENST00000610404 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 MASP2O00187 686 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 GPR39O43194 453 aa8.51□□□□□ -1.05
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TTR-204ENST00000610404 CD8BP10966 210 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CA5AP35218 305 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 GJC1P36383 396 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CTSCP53634 463 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 RRADP55042 308 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 GSDMDP57764 484 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 DMPKQ09013 629 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 NFE2L1Q14494 772 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 KYNUQ16719 465 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 KLHL35Q6PF15 583 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 PQLC3Q8N755 202 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 OR1L3Q8NH93 324 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 CPT1BQ92523 772 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 VPS35Q96QK1 796 aa8.51□□□□□ -1.05
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TTR-204ENST00000610404 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 ISCUQ9H1K1 167 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 C5AR2Q9P296 337 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 MYO6Q9UM54 1294 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 BTRCQ9Y297 605 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.51□□□□□ -1.05
TTR-204ENST00000610404 APCP25054 2843 aa8.51□□□□□ -1.05
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