RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PKP3Q9Y446 797 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MED13LQ71F56 2210 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DYTNA2CJ06 578 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ALAS2P22557 587 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMSP52788 366 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRTAP10-9P60411 292 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDK2Q15119 407 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INAQ16352 499 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C14orf79Q96F83 325 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMF1Q96S06 567 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC53A6NM62 1247 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOCS6O14544 535 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PMPCBO75439 489 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARSEP51690 589 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TLE4Q04727 773 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC14A2Q15849 920 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBBP7Q16576 425 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SARM1Q6SZW1 724 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPESP1Q6UW49 350 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DLG3Q92796 817 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAAR6Q96RI8 345 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM60AQ9NP50 221 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO1FO00160 1098 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.042e-10■■□□□ 13.8
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UQCRHP07919 91 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AGAP20933 346 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HM13Q8TCT9 377 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF398Q8TD17 642 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FKBP10Q96AY3 582 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ISCUQ9H1K1 167 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMOXQ9NWM0 555 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBP1Q9NZI7 540 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HACD3Q9P035 362 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IL17CQ9P0M4 197 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TACC2O95359 2948 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 H3BMH7 237 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLHL18O94889 574 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLDN14O95500 239 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RALBP11234 206 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITGAXP20702 1163 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCL7AQ4VC05 210 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DAAM2Q86T65 1068 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM73Q86UV7 250 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PQLC3Q8N755 202 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NAT14Q8WUY8 206 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TADA1Q96BN2 335 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRTNQ99748 197 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XKR8Q9H6D3 395 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR54Q9H977 334 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPTBP11277 2137 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C19orf84I3L1E1 186 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FANCGO15287 622 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HCRTR1O43613 425 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms