RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MVB12BQ9H7P6 319 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM60AQ9NP50 221 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 C5AR2Q9P296 337 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BMH7 237 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CBFA2T2O43439 604 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 HCRTR1O43613 425 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TPM1P09493 284 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CBSLP0DN79 551 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CBSP35520 551 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CD151P48509 253 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND5AQ6IQ26 1287 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM73Q86UV7 250 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 HEXDCQ8WVB3 486 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ICKQ9UPZ9 632 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ESPL1Q14674 2120 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 WIPF3A6NGB9 483 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 HBQ1P09105 142 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS56P0CW18 603 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MC4RP32245 332 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB110Q30KQ9 67 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf189Q5VU69 101 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MLIPQ5VWP3 458 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SPESP1Q6UW49 350 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR135Q8IZ08 494 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCKQ8N0W5 287 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TFR2Q9UP52 801 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 LDB2O43679 373 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CBX6O95503 412 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 LDLRP01130 860 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ACRV1P26436 265 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 HADHAP40939 763 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXL2P58012 376 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SPARCL1Q14515 664 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SSPNQ14714 243 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZIC1Q15915 447 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTL9Q8TC94 416 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTBP11277 2137 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MASP2O00187 686 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2B3O76000 313 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSBP07858 339 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRA4P48169 554 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 RPA4Q13156 261 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPSAP1Q14558 356 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR33Q49SQ1 333 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF10Q5QP82 559 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA9Q86WD7 417 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN19Q8N6F1 224 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5DQ92835 1189 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP5Q96PP8 586 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP9Q96S59 729 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B7P16662 529 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTP40126 519 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBPC3Q14896 1274 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC181Q5TID7 509 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDD2Q6NTF9 364 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT16Q8N428 558 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC1AQ8NC01 280 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AR1Q8NGP9 310 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IP6K3Q96PC2 410 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A14Q96R47 310 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf62Q9BQA9 187 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNN4O15554 427 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FOLR3P41439 243 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA1P43355 309 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A5Q14940 896 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.76■■□□□ 1.55
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