RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.34□□□□□ -0.59
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM129CQ86XR2 697 aa11.33□□□□□ -0.6
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CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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CAPNS1-209ENST00000590049 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.32□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.32□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFATQ9P243 1243 aa11.32□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.32□□□□□ -0.6
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