RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CPZQ66K79 652 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SPESP1Q6UW49 350 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SCD5Q86SK9 330 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ITIH5Q86UX2 942 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 KRT73Q86Y46 540 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RBFAQ8N0V3 343 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD4AQ8N468 514 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CPA6Q8N4T0 437 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FIG4Q92562 907 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GLMNQ92990 594 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMG2Q969U7 264 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 TMCO6Q96DC7 493 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 LINGO1Q96FE5 620 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CDCA5Q96FF9 252 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA17Q96L03 361 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GAD1Q99259 594 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EPYCQ99645 322 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR21Q99679 349 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CORO1BQ9BR76 489 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PDFQ9HBH1 243 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ACSS2Q9NR19 701 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OPTCQ9UBM4 332 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 PKP3Q9Y446 797 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.58□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 ILVBLA1L0T0 632 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM172BPA6NC97 362 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBBXA8MT70 800 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 J3QRK9 145 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FFAR2O15552 330 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KDELR3O43731 214 aa7.57□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 OR4F21O95013 312 aa7.57□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 FMO4P31512 558 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A3P33764 101 aa7.57□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 HNMTP50135 292 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NEK2P51955 445 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PNLIPRP1P54315 467 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGA1P56199 1179 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 VAC14Q08AM6 782 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCA4Q14CN2 919 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SPCS2Q15005 226 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PON2Q15165 354 aa7.57□□□□□ -1.2
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