RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TLCD2A6NGC4 264 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 USP27XA6NNY8 438 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MATN2O00339 956 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PFDN6O15212 129 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KDM1AO60341 852 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KATNA1O75449 491 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFS3O75489 264 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG6O75602 509 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 VAPBO95292 243 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 EBLN1P0CF75 366 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FOLR1P15328 257 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF28P17035 718 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PAMP19021 973 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PSMA3P25788 255 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NMBRP28336 390 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TTPAP49638 278 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TEX35Q5T0J7 233 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf46Q6P387 395 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 XKR5Q6UX68 686 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PACS1Q6VY07 963 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF534Q76KX8 674 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KMT5CQ86Y97 462 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FANCEQ9HB96 536 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FGF21Q9NSA1 209 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SYBUQ9NX95 663 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PIPSLA2A3N6 862 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 IQCF5A8MTL0 148 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf74A8MZ97 194 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BTN3A3O00478 584 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 AVILO75366 819 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C1QL1O75973 258 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ND3P03897 115 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NTRK1P04629 796 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 APOA4P06727 396 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PRKAR1AP10644 381 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FGF5P12034 268 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TCN2P20062 427 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TPSB2P20231 275 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CCR7P32248 378 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DLSTP36957 453 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ACVR1Q04771 509 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD18Q0P651 414 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ABRQ12979 859 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA3AQ14563 771 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TMED2Q15363 201 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R7Q15435 360 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TPSAB1Q15661 275 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TTC27Q6P3X3 843 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TTC23LQ6PF05 361 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 COG1Q8WTW3 980 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF592Q92610 1267 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TTC9Q92623 222 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD3Q96ES6 412 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 WBP1Q96G27 269 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms