RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 CDK15Q96Q40 435 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF559Q9BR84 538 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CNPY3Q9BT09 278 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GPAMQ9HCL2 828 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CDC23Q9UJX2 597 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AKAP6Q13023 2319 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 F8VZ95 297 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 BTN3A1O00481 513 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PROM1O43490 865 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2B3O76000 313 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HLA-DPA1P20036 260 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AMPD1P23109 780 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HCAR3P49019 387 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MEOX1P50221 254 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TMPRSS15P98073 1019 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CACNG1Q06432 222 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ITKQ08881 620 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 XRCC4Q13426 336 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PCOLCEQ15113 449 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZIC1Q15915 447 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NKG7Q16617 165 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 COX15Q7KZN9 410 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MON1BQ7L1V2 547 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AMZ2Q86W34 360 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF677Q86XU0 584 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR135Q8IZ08 494 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 BBS5Q8N3I7 341 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MEIOBQ8N635 442 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 C18orf12Q96KH6 178 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 WWP1Q9H0M0 922 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DYTNA2CJ06 578 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GSAPA4D1B5 854 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 KCNJ13O60928 360 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 GFPT2O94808 682 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TOXO94900 526 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 WDPCPO95876 746 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ONECUT2O95948 504 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MMP2P08253 660 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 INHBBP09529 407 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 VCLP18206 1134 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MSX1P28360 303 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 CDH6P55285 790 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 METRNLQ641Q3 311 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 Q8N3U1 123 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 AGAP11Q8TF27 550 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-217ENST00000580654 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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