RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	LIX1	Q8N485	282 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ACD	Q96AP0	544 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TLR9	Q9NR96	1032 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf109	Q9NX04	203 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SRRD	Q9UH36	339 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	YIPF1	Q9Y548	306 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MANBA	O00462	879 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FFAR3	O14843	346 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GPR42	O15529	346 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	STK16	O75716	305 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CST1	P01037	141 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KRT6A	P02538	564 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KRT6B	P04259	564 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PCNA	P12004	261 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KRT6C	P48668	564 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PLIN5	Q00G26	463 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ATG9B	Q674R7	924 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	USP7	Q93009	1102 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FAM162A	Q96A26	154 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	USE1	Q9NZ43	259 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	INVS	Q9Y283	1065 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CXCR6	O00574	342 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ATE1	O95260	518 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SPAM1	P38567	509 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GDF5	P43026	501 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TMBIM6	P55061	237 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NEDD8	Q15843	81 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO30	Q8TB52	745 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MAGED4	Q96JG8	741 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	OR52E6	Q96RD3	313 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR8	Q9H981	624 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		18.03	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PITPNM1	O00562	1244 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GNGT2	O14610	69 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN9	O95484	217 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA5	P08758	320 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	BPI	P17213	487 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	IL1RN	P18510	177 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HNF1B	P35680	557 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP1	P43487	201 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	STT3A	P46977	705 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GALK1	P51570	392 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HMGCS1	Q01581	520 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	AAK1	Q2M2I8	961 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MICU2	Q8IYU8	434 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NXPE1	Q8N323	547 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PJA1	Q8NG27	643 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TOR3A	Q9H497	397 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559		K7ERQ8	282 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	GFRA2	O00451	464 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ABCB7	O75027	752 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN7	O95471	211 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TCF3	P15923	654 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	NSG1	P42857	185 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	NRIP1	P48552	1158 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN3	Q16667	212 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LHX8	Q68G74	356 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC8	Q8TC99	324 aa		18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	HTT	P42858	3142 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A1	P22309	533 aa		18.01	■□□□□ 0.47

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