RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RSC1A1Q92681 617 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GTH6 734 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35F4A4IF30 521 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRR33A8MZF0 331 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 E9PI62 339 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDH16O75309 829 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GLP2RO95838 553 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PDGFAP04085 211 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCSK2P16519 638 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HK1P19367 917 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAD52P43351 418 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SEPHS1P49903 392 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SEC13P55735 322 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPCS2Q15005 226 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CARTPTQ16568 116 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CCL14Q16627 93 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MORN1Q5T089 497 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UTS2BQ765I0 119 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SSX6Q7RTT6 188 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TOP1MTQ969P6 601 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 S100A13Q99584 98 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 REEP4Q9H6H4 257 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GAREM1Q9H706 876 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FADS1O60427 444 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SNAP91O60641 907 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDK4P11802 303 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TALDO1P37837 337 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MMP13P45452 471 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM32Q8TC27 787 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POF1BQ8WVV4 589 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRIB2Q92519 343 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KAT2AQ92830 837 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CMTM3Q96MX0 182 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SSR3Q9UNL2 185 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN3O60637 253 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF217O75362 1048 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IQCF3P0C7M6 154 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IMPDH1P20839 514 aa6.2□□□□□ -1.42
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