RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 SLMAPQ14BN4 828 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 LCN9Q8WX39 176 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 INPP5DQ92835 1189 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CD180Q99467 661 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 VWA7Q9Y334 891 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 AK5Q9Y6K8 562 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CACNA1AO00555 2505 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OR5K3A6NET4 321 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 MATN4O95460 622 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 C9P02748 559 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CATP04040 527 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 JMJD7P0C870 316 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 MPC1LP0DKB6 136 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 THRAP10827 490 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 GABRB3P28472 473 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CSF2RBP32927 897 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 PDX1P52945 283 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CFHR1Q03591 330 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 PRKG2Q13237 762 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 NAB1Q13506 487 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 VRK3Q8IV63 474 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CARFQ8N187 725 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 GPATCH11Q8N954 259 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 GATA6Q92908 595 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 FAM136AQ96C01 138 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 TGM7Q96PF1 710 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 GPR21Q99679 349 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CPNE1Q99829 537 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 HGH1Q9BTY7 390 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OGFRQ9NZT2 677 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 DKK4Q9UBT3 224 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 SATB2Q9UPW6 733 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-224ENST00000551155 OR6C74A6NCV1 312 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 FAM159BA6NKW6 160 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 A8MU76 341 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 C2orf74A8MZ97 194 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 PLD2O14939 933 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 MAP3K7O43318 606 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 ZBTB14O43829 449 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 RASSF9O75901 435 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 C1orf105O95561 183 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 MPOP05164 745 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 GP5P40197 560 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 SLC12A2P55011 1212 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 GPX6P59796 221 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 IL2P60568 153 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-224ENST00000551155 GABREP78334 506 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms