RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 GRIA1P42261 906 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 DBN1Q16643 649 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 UGT8Q16880 541 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ARMC3Q5W041 872 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 IRGCQ6NXR0 463 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CLDN19Q8N6F1 224 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CCDC89Q8N998 374 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 THAP4Q8WY91 577 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 E7EVH7 732 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 MATN2O00339 956 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 RASSF9O75901 435 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 FGGP02679 453 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 POLBP06746 335 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 APRTP07741 180 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 MSL3P1P0C860 447 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 SEPHS1P49903 392 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 CDK16Q00536 496 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 SNX1Q13596 522 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-221ENST00000550734 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 OOSP2Q86WS3 158 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 D2HGDHQ8N465 521 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CT55Q8WUE5 264 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 NAT14Q8WUY8 206 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 RNF31Q96EP0 1072 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ACTL8Q9H568 366 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 BTRCQ9Y297 605 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CEACAM4O75871 244 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TIAF1O95411 115 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 FTH1P02794 183 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PRSS56P0CW18 603 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ACADLP28330 430 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PTPN4P29074 926 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 MAGEA6P43360 314 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PPP1CAP62136 330 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 HSD11B2P80365 405 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 GSE1Q14687 1217 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PLCL1Q15111 1095 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CCDC38Q502W7 563 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PCID2Q5JVF3 399 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ZNF534Q76KX8 674 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 OR4L1Q8NH43 312 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 HDAC10Q969S8 669 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ZNF778Q96MU6 729 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TTC1Q99614 292 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 MAP3K3Q99759 626 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 SLC25A23Q9BV35 468 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 IL22Q9GZX6 179 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PDE7BQ9NP56 450 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 POMT2Q9UKY4 750 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 SLC5A10A0PJK1 596 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 OR6C74A6NCV1 312 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 F8W8V4 182 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 CEP104O60308 925 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-221ENST00000550734 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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