RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 TP73O15350 636 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 NIPSNAP2O75323 286 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ERVK-10P10266 1014 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 SLC5A2P31639 672 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 TSPAN7P41732 249 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 RAB15P59190 212 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 CAV1Q03135 178 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 C8orf74Q6P047 294 aa21.35■■□□□ 1.01
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PTPRK-222ENST00000532751 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 VRK3Q8IV63 474 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 MNS1Q8NEH6 495 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 E7ESA3 106 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRK-222ENST00000532751 MPP1Q00013 466 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ABRQ12979 859 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 UBXN4Q92575 508 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 FOPNLQ96NB1 174 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 TLCD2A6NGC4 264 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRK-222ENST00000532751 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 STEAP4Q687X5 459 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 TTC23LQ6PF05 361 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 CNTN4Q8IWV2 1026 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB2Q8N680 514 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 KCNE4Q8WWG9 221 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ART4Q93070 314 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-222ENST00000532751 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.33■■□□□ 1.01
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PTPRK-222ENST00000532751 ARL4DP49703 201 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1CAP62136 330 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 MC2RQ01718 297 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 CARFQ8N187 725 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 BMPERQ8N8U9 685 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 KCNJ9Q92806 393 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRK-222ENST00000532751 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K3Q99759 626 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
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PTPRK-222ENST00000532751 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRK-222ENST00000532751 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.32■■□□□ 1
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PTPRK-222ENST00000532751 CTAGE8P0CG41 777 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 ATP5DP30049 168 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 PLTPP55058 493 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRK-222ENST00000532751 CNSTQ6PJW8 725 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 GALNT7Q86SF2 657 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 KMT5CQ86Y97 462 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 ZPBPQ9BS86 351 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-222ENST00000532751 DPH1Q9BZG8 443 aa21.31■■□□□ 1
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