RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 RAB10P61026 200 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.235e-8■■■■□ 19.9
PACS1-208ENST00000529677 CTBSQ01459 385 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 RPA4Q13156 261 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TMED2Q15363 201 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 KRT71Q3SY84 523 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 NRROSQ86YC3 692 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CYP4X1Q8N118 509 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB2Q8N680 514 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 ELMO1Q92556 727 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 INPP5DQ92835 1189 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 GLMNQ92990 594 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 COG4Q9H9E3 785 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SNX15Q9NRS6 342 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.46■□□□□ 0.23
PACS1-208ENST00000529677 SMIM23A6NLE4 172 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 YKT6O15498 198 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ATP8B1O43520 1251 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 RFPL1O75677 317 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PIAS2O75928 621 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SLCO2B1O94956 709 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CBSLP0DN79 551 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CBSP35520 551 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SLC26A3P40879 764 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 INSCQ1MX18 579 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 METRNLQ641Q3 311 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SH2D5Q6ZV89 423 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PIM3Q86V86 326 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 EID2Q8N6I1 236 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ACMSDQ8TDX5 336 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SPASTQ9UBP0 616 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TBK1Q9UHD2 729 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.45■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TLDC2A0PJX2 215 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 A6NCN8 305 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TPP1O14773 563 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TSPAN12O95859 305 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 APOA4P06727 396 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CDK4P11802 303 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ITGB6P18564 788 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CCNFP41002 786 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SLC12A2P55011 1212 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.221e-14■□□□□ 11.2
PACS1-208ENST00000529677 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 NFE2L1Q14494 772 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 INAVAQ3KP66 663 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TRABD2AQ86V40 505 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SH3GL2Q99962 352 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 KLC4Q9NSK0 619 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PACS1-208ENST00000529677 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
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