RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528145.5

ATG13-210, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-210ENST00000528145 RIPK2O43353 540 aa13□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 CPNE6O95741 557 aa13□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 KRT87PA6NCN2 255 aa12.99□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 CBSP35520 551 aa12.99□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.99□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 ICKQ9UPZ9 632 aa12.99□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.98□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 C1orf105O95561 183 aa12.98□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 ITGA2BP08514 1039 aa12.98□□□□□ -0.33
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ATG13-210ENST00000528145 AMD1P17707 334 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 SPRP35270 261 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 RGS4P49798 205 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 PPP1CAP62136 330 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 POU4F1Q01851 419 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 BMPR2Q13873 1038 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 GRB7Q14451 532 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 ISXQ2M1V0 245 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 CCSMST1Q4G0I0 132 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 TMEM207Q6UWW9 146 aa12.98□□□□□ -0.33
ATG13-210ENST00000528145 CYHR1Q6ZMK1 362 aa12.98□□□□□ -0.33
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