RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	DISP1	Q96F81	1524 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP170	Q5SW79	1584 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0556	O60303	1618 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702		M0QZ24	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RASGRF2	O14827	1237 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MCF2L	O15068	1137 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TOMM70	O94826	608 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	EGF	P01133	1207 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LCK	P06239	509 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP3	P08254	477 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	VCL	P18206	1134 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RPA1	P27694	616 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CHAT	P28329	748 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNA3	P32297	505 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKCE	Q02156	737 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FOLH1	Q04609	750 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LPIN1	Q14693	890 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CDO1	Q16878	200 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIL	Q7L0X0	811 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF410	Q86VK4	478 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	EXD1	Q8NHP7	514 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RIT1	Q92963	219 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF560	Q96MR9	790 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SFXN2	Q96NB2	322 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS33B	Q9H267	617 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NGB	Q9NPG2	151 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF3A	Q9Y496	699 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702		F8W810	466 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CTDSPL	O15194	276 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFS4	O43181	175 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	AP5Z1	O43299	807 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIP5K2	O43314	1243 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RIPK2	O43353	540 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPAN1	O60635	241 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	BCAR3	O75815	825 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	GLCE	O94923	617 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN7	O95471	211 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FGB	P02675	491 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPY4	P0CV99	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPY10	P0CW01	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TPBGL	P0DKB5	382 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	G6PD	P11413	515 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CD58	P19256	250 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMC4	P43686	418 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	HNMT	P50135	292 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79

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