RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 BRD9Q9H8M2 597 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NTN4Q9HB63 628 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HPS4Q9NQG7 708 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 AREL1O15033 823 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LRIG2O94898 1065 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ICAM2P13598 275 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LIMK2P53671 638 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 EPS8Q12929 822 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LCN8Q6JVE9 175 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 XYLT1Q86Y38 959 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 OPTCQ9UBM4 332 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SCN5AQ14524 2016 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 APOL1O14791 398 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NOBOXO60393 691 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LDLRP01130 860 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GJA1P17302 382 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 UQCRC1P31930 480 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SPRED2Q7Z698 418 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GTF2H4Q92759 462 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINB11Q96P15 392 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 IRAK3Q9Y616 596 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FXYD1O00168 92 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NR5A2O00482 541 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF15O94989 841 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PGAM1P18669 254 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 GPR15P49685 360 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLC6A3Q01959 620 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 GRTP1Q5TC63 336 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 STK32CQ86UX6 486 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM63Q969Q1 353 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ISL2Q96A47 359 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CPNE1Q99829 537 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF639Q9UID6 485 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 KRT87PA6NCN2 255 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 AGAP5A6NIR3 686 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 CYP4F8P98187 520 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF544Q6NX49 715 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC185Q8N715 623 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RNF145Q96MT1 663 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 LHX5Q9H2C1 402 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 WDCPQ9H6R7 721 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 XPR1Q9UBH6 696 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 INVSQ9Y283 1065 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 A8MUA0 341 aa9.92□□□□□ -0.82
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