RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.4■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.4■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.4■□□□□ 0.22
HERC3-211ENST00000513325 CCDC78A2IDD5 438 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 C2orf74A8MZ97 194 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TMEM63AO94886 807 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CACNG1Q06432 222 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 STYXQ8WUJ0 223 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 AMFRQ9UKV5 643 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SPTBP11277 2137 aa16.39■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 E7EQ34 232 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF749O43361 778 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 VPS4BO75351 444 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 AP2A2O94973 939 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GSTM1P09488 218 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GP1BBP13224 206 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 UQCRFS1P47985 274 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF75DP51815 510 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 VAV2P52735 878 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GDF10P55107 478 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ITGA1P56199 1179 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GSTM4Q03013 218 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PEX26Q7Z412 305 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TTC13Q8NBP0 860 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 FAM60AQ9NP50 221 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 VPS4AQ9UN37 437 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ICKQ9UPZ9 632 aa16.38■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF185O15231 689 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM4O75871 244 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 AP2A1O95782 977 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 NSG1P42857 185 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 BRD3Q15059 726 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 NCF4Q15080 339 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 P3H1Q32P28 736 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SPESP1Q6UW49 350 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1328Q86T90 577 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TRIM73Q86UV7 250 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 HOOK3Q86VS8 718 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB2Q8N680 514 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ELMO1Q92556 727 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ASF1AQ9Y294 204 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MED13Q9UHV7 2174 aa16.37■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 BLACEA4D250 179 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 MROH6A6NGR9 719 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR51F1A6NGY5 319 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 A6NL46 340 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 C9J4A7 227 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PSMD3O43242 534 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 HBQ1P09105 142 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 UGT2B7P16662 529 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 AGXTP21549 392 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GNLYP22749 145 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ACADLP28330 430 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CCDC38Q502W7 563 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 GPR135Q8IZ08 494 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.36■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 QSOX1O00391 747 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 HCRTR1O43613 425 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 FTCDO95954 541 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 TPBGLP0DKB5 382 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 CBSLP0DN79 551 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 PSMA3P25788 255 aa16.35■□□□□ 0.21
HERC3-211ENST00000513325 FOXN2P32314 431 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms