RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC1Q99614 292 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PCYOX1Q9UHG3 505 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GPC4O75487 556 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PVRP15151 417 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 AOAHP28039 575 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP4F2P78329 520 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR19Q15760 415 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MSS51Q4VC12 460 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPUQ71F23 418 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM73Q86UV7 250 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PPIL6Q8IXY8 311 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PWWP2AQ96N64 755 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CD180Q99467 661 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD6Q9BX69 1037 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ULBP3Q9BZM4 244 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC88CQ9P219 2028 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CTAGE9A4FU28 777 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFS3O75489 264 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PRB1P04280 392 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 IVDP26440 423 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP1A2P50993 1020 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CILP2Q8IUL8 1156 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 IL22RA1Q8N6P7 574 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC9Q92623 222 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SPHK1Q9NYA1 384 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GALPQ9UBC7 116 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PCM1Q15154 2024 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 BSNQ9UPA5 3926 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SDR42E2A6NKP2 422 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0754O94854 1291 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF5P12034 268 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GAL1P15907 406 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH3P22223 829 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FMO4P31512 558 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC1A2P43004 574 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 BDKRB1P46663 353 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAA1Q13131 559 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GRB7Q14451 532 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC5AQ6ZN44 842 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM135Q86UB9 458 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NLGN4XQ8N0W4 816 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 D2HGDHQ8N465 521 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 MENTQ9BUN1 341 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SOHLH2Q9NX45 425 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTR10Q9NZ32 417 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 BTRCQ9Y297 605 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NFS1Q9Y697 457 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TTI1O43156 1089 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms