RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 DTX1Q86Y01 620 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT222Q8N1A0 295 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CRELD1Q96HD1 420 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 FOPNLQ96NB1 174 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 NAT9Q9BTE0 207 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 P2RY12Q9H244 342 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 C2orf74A8MZ97 194 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 E5RI56 91 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CHRM3P20309 590 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ARNTP27540 789 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1CAP62136 330 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ABRQ12979 859 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 MORF4L2Q15014 288 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PDIK1LQ8N165 341 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PMEPA1Q969W9 287 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 APMAPQ9HDC9 416 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 RARRES3Q9UL19 164 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD1O60671 282 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 GPC4O75487 556 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 STK17BO94768 372 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC4O95801 387 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PGAM1P18669 254 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEA3P43357 314 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3BP2P78314 561 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 NKD1Q969G9 470 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 FANCEQ9HB96 536 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 POMT2Q9UKY4 750 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PIPSLA2A3N6 862 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 K7ENP7 123 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SLCO2B1O94956 709 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TUBB3Q13509 450 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ESX1Q8N693 406 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 LPGAT1Q92604 370 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SNF8Q96H20 258 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT12Q99456 494 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 XKR8Q9H6D3 395 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-210ENST00000505941 BTN3A3O00478 584 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 BTN3A1O00481 513 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 TTI1O43156 1089 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 MT-ND3P03897 115 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 FGF5P12034 268 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 RHDQ02161 417 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 BBS9Q3SYG4 887 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 VASH2Q86V25 355 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 BBOF1Q8ND07 529 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 OR8K5Q8NH50 307 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms