RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	URAD	A6NGE7	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC01565	O15544	149 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	GRID2	O43424	1007 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TBX10	O75333	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TSHB	P01222	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	MC5R	P33032	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CCR3	P51677	355 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRK-215	ENST00000498284	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PRB8	838 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	HYKK	A2RU49	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	OR10H2	O60403	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	CIDEA	O60543	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	TOMM70	O94826	608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	INHBA	P08476	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	PFKFB1	P16118	471 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	FLT1	P17948	1338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	CDKN1A	P38936	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	RALGDS	Q12967	914 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	MYADM	Q96S97	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284		A8MXE2	369 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRK-215	ENST00000498284		E9PI62	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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