RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 POLHQ9Y253 713 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 HEATR9A2RTY3 570 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 GSAPA4D1B5 854 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 K7EM74 188 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 CSRP3P50461 194 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 RPS18P62269 152 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 LCN10Q6JVE6 187 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 OR1L3Q8NH93 324 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 SGSM3Q96HU1 749 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 RAB6BQ9NRW1 208 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 SOHLH2Q9NX45 425 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD12Q6UB98 2062 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP6O43182 974 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PVRP15151 417 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ADRA1DP25100 572 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 RPL22P35268 128 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 RORAP35398 523 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 KCNC4Q03721 635 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM126BQ8IUX1 230 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ELMO1Q92556 727 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 GPR87Q9BY21 358 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TCAF1Q9Y4C2 921 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 COL12A1Q99715 3063 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CDC14CA4D256 554 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 QSOX1O00391 747 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PTPN4P29074 926 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 GSDMDP57764 484 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TLE1Q04724 770 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 RPS6KA1Q15418 735 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 AFTPHQ6ULP2 937 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 EPN3Q9H201 632 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ACTR10Q9NZ32 417 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CDYLQ9Y232 598 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PIPSLA2A3N6 862 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 FTH1P02794 183 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CAPN1P07384 714 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 LMAN1P49257 510 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PMS2P54278 862 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 IL10RAQ13651 578 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 BRD3Q15059 726 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CCNG2Q16589 344 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 IZUMO3Q5VZ72 239 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 DSELQ8IZU8 1212 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 OR4L1Q8NH43 312 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PEX13Q92968 403 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL25Q9H0H3 589 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CHST8Q9H2A9 424 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PAK5Q9P286 719 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf74A8MZ97 194 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 H3BMH7 237 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 APRTP07741 180 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 NR1D1P20393 614 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 GABRA4P48169 554 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 UGT8Q16880 541 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF449Q6P9G9 518 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 SPESP1Q6UW49 350 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 UNC5AQ6ZN44 842 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 OR2A14Q96R47 310 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 SYTL2Q9HCH5 934 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 FAM60AQ9NP50 221 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PCMTD2Q9NV79 361 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 SPHK1Q9NYA1 384 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM150CB9EJG8 249 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 MEN1O00255 615 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 HCRTR1O43613 425 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CASRP41180 1078 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ZIC1Q15915 447 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 SYVN1Q86TM6 617 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 VRK3Q8IV63 474 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TBC1D21Q8IYX1 336 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 OR5K2Q8NHB8 316 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 MR1Q95460 341 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM55Q9BYV6 548 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ANAPC2Q9UJX6 822 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ASF1AQ9Y294 204 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PTPN13Q12923 2485 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms