RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEB17A8MXT2 336 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 RCVRNP35243 200 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 AP1S2P56377 157 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GPR107Q5VW38 600 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 NEK5Q6P3R8 708 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 FAM171BQ6P995 826 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 RINLQ6ZS11 566 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 FAM46DQ8NEK8 389 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CMTM6Q9NX76 183 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 EHD3Q9NZN3 535 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 MTRRQ9UBK8 725 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 IL36AQ9UHA7 158 aa13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 DPPA5A6NC42 116 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SEC24AO95486 1093 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 IGFALSP35858 605 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 HERVK_113P63132 956 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC32Q14392 662 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZVL8 140 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SLC34A3Q8N130 599 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CADM2Q8N3J6 435 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 DCAKDQ8WVC6 231 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ERVK-6Q9BXR3 956 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 OXSMQ9NWU1 459 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM59LQ9UK28 342 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA2Q9UM82 520 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 A8MT66 165 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 PFKMP08237 780 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 C4BPBP20851 252 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GHRHRQ02643 423 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 PLEKHG6Q3KR16 790 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 REP15Q6BDI9 236 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 KRT77Q7Z794 578 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ARL10Q8N8L6 244 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SLC38A4Q969I6 547 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 BTBD3Q9Y2F9 522 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 TGFB1P01137 390 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CPN2P22792 545 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CCNFP41002 786 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 MASP1P48740 699 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF33AQ06730 810 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CBR4Q8N4T8 237 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 UBR7Q8N806 425 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 LAMB4A4D0S4 1761 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0D9SEW6 157 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 TNFRSF11BO00300 401 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CDC7O00311 574 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ECI2O75521 394 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SCELO95171 688 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GJB5O95377 273 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 IFNGP01579 166 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GPIP06744 558 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 IGFBP5P24593 272 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GGT5P36269 586 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 GPX6P59796 221 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ERVK-8P63133 956 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 RHAGQ02094 409 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 TRIM32Q13049 653 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 TEAD4Q15561 434 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 KCTD21Q4G0X4 260 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 C22orf39Q6P5X5 142 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 PIM3Q86V86 326 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 FAM81AQ8TBF8 368 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 DUSP26Q9BV47 211 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 NEK6Q9HC98 313 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SLC22A14Q9Y267 594 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 AK5Q9Y6K8 562 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 SQORQ9Y6N5 450 aa13.12□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa13.11□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 DLX3O60479 287 aa13.11□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 MMP20O60882 483 aa13.11□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 BEST1O76090 585 aa13.11□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 RB1P06400 928 aa13.11□□□□□ -0.31
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms