RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 JUPP14923 745 aa21.98■■□□□ 1.11
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ARPC1B-218ENST00000484375 ABCG1P45844 678 aa21.98■■□□□ 1.11
ARPC1B-218ENST00000484375 CAPZBP47756 277 aa21.98■■□□□ 1.11
ARPC1B-218ENST00000484375 CDKN2DP55273 166 aa21.98■■□□□ 1.11
ARPC1B-218ENST00000484375 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.98■■□□□ 1.11
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ARPC1B-218ENST00000484375 GALPQ9UBC7 116 aa21.98■■□□□ 1.11
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ARPC1B-218ENST00000484375 FAM153CQ494X1 144 aa21.97■■□□□ 1.11
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ARPC1B-218ENST00000484375 SAT1P21673 171 aa21.94■■□□□ 1.1
ARPC1B-218ENST00000484375 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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ARPC1B-218ENST00000484375 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ARPC1B-218ENST00000484375 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 41.9
ARPC1B-218ENST00000484375 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.94■■□□□ 1.1
ARPC1B-218ENST00000484375 USP53Q70EK8 1073 aa21.94■■□□□ 1.1
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.94■■□□□ 1.1
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