RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 LPGAT1Q92604 370 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SNF8Q96H20 258 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 NAT9Q9BTE0 207 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 E5RI56 91 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SLCO2B1O94956 709 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC4O95801 387 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CDH3P22223 829 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SHMT2P34897 504 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP1A2P50993 1020 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGA8P53708 1063 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CXADRP78310 365 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CTBP1Q13363 440 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 TGIF1Q15583 401 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 MANEAQ5SRI9 462 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC23LQ6PF05 361 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPUQ71F23 418 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 BBOF1Q8ND07 529 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PMEPA1Q969W9 287 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6C1Q96RD1 312 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 XKR8Q9H6D3 395 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 APMAPQ9HDC9 416 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SEMA5BQ9P283 1151 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SDK2Q58EX2 2172 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf74A8MZ97 194 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP3K7O43318 606 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 S1PR4O95977 384 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ARL4CP56559 192 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3BP2P78314 561 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 IL11RAQ14626 422 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC81Q6ZN84 652 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 VRK3Q8IV63 474 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CARFQ8N187 725 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CRELD1Q96HD1 420 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 FOPNLQ96NB1 174 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 BIRC8Q96P09 236 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PDE7BQ9NP56 450 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CDYLQ9Y232 598 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM187AA6NFU0 413 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 BTN3A3O00478 584 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 BTN3A1O00481 513 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 NIPSNAP2O75323 286 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 BANF1O75531 89 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 HSD11B2P80365 405 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ACY1Q03154 408 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNMB4Q86W47 210 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 DTX1Q86Y01 620 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 IL22RA1Q8N6P7 574 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PRORYQ9H606 182 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SOHLH2Q9NX45 425 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 POMT2Q9UKY4 750 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 SNX24Q9Y343 169 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-209ENST00000484097 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 PIPSLA2A3N6 862 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf54Q08AI8 447 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 VAC14Q08AM6 782 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 CRYMQ14894 314 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 HIF1AQ16665 826 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 MSS51Q4VC12 460 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGAP40Q5TG30 622 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms