RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 XKR8Q9H6D3 395 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 GALPQ9UBC7 116 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZZEF1O43149 2961 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 H3BMM5 538 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 BTN3A3O00478 584 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TTC4O95801 387 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ELK3P41970 407 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A2P43004 574 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ABCG1P45844 678 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ABRQ12979 859 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CLN3Q13286 438 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TMED2Q15363 201 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ANKS6Q68DC2 871 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 KCNMB4Q86W47 210 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CALML6Q8TD86 181 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 UBXN4Q92575 508 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CD180Q99467 661 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 APMAPQ9HDC9 416 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 POLG2Q9UHN1 485 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CDC23Q9UJX2 597 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ICKQ9UPZ9 632 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 KPNA5O15131 536 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 KLK10O43240 276 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CD82P27701 267 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ARL4CP56559 192 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 RAB15P59190 212 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SH3BP2P78314 561 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DTX1Q86Y01 620 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PPM1MQ96MI6 270 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CTRCQ99895 268 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TLCD2A6NGC4 264 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 BTN3A1O00481 513 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HAUS5O94927 633 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-10P10266 1014 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CHRM3P20309 590 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PRKAA1Q13131 559 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CBLBQ13191 982 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 GBX1Q14549 363 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TGIF1Q15583 401 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HIF1AQ16665 826 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DUPD1Q68J44 220 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 BBOF1Q8ND07 529 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LRRC39Q96DD0 335 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CRELD1Q96HD1 420 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SPRY4Q9C004 299 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DPH5Q9H2P9 285 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 WHRNQ9P202 907 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 POMT2Q9UKY4 750 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 MED16Q9Y2X0 877 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 E7ESA3 106 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 MATN2O00339 956 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 NDC80O14777 642 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 LIPCP11150 499 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 MPP1Q00013 466 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GRB7Q14451 532 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 STEAP4Q687X5 459 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KMT5CQ86Y97 462 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FAM136AQ96C01 138 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CFAP36Q96G28 342 aa20.32■□□□□ 0.84
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