RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 KLQ9UEF7 1012 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1B0GVM2 712 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PQJ5 194 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PRSS38A1L453 326 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KBTBD13C9JR72 458 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 E9PAM4 449 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MASP2O00187 686 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CLDN4O14493 209 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 BUB1O43683 1085 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DTNBO60941 627 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SOX30O94993 753 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 STSP08842 583 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 IL7P13232 177 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MTHFD2P13995 350 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DARSP14868 501 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TNNI1P19237 187 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RPS6KB1P23443 525 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 POU1F1P28069 291 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HTR1BP28222 390 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CASP1P29466 404 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ACTR1BP42025 376 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 IL12RB1P42701 662 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC1A3P43003 542 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC1A4P43007 532 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PPP3CCP48454 512 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SERPINB10P48595 397 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HNMTP50135 292 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MFAP3P55082 362 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CYP27A1Q02318 531 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 GNA12Q03113 381 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TAB1Q15750 504 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 EPC2Q52LR7 807 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 LPCAT4Q643R3 524 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 VSTM1Q6UX27 236 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KCTD1Q719H9 257 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NT5DC3Q86UY8 548 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CATSPER3Q86XQ3 398 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PARP8Q8N3A8 854 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MPP5Q8N3R9 675 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 C7orf31Q8N865 590 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 BEST2Q8NFU1 509 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ST8SIA2Q92186 375 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CPT1BQ92523 772 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RFT1Q96AA3 541 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PSMB7Q99436 277 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NEU1Q99519 415 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CHP1Q99653 195 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MND1Q9BWT6 205 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SETD4Q9NVD3 440 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 LIPT1Q9Y234 373 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PSAT1Q9Y617 370 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PIPSLA2A3N6 862 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM170BA6NMN3 283 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KCNJ18B7U540 433 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RGS5O15539 181 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CA12O43570 354 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HCRTR2O43614 444 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DFNA5O60443 496 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms