RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468162.5

PFKFB4-210, Transcript of 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 4, humanhuman

TSL 5

Gene PFKFB4, Length 576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4-210ENST00000468162 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.16□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.16□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PATJQ8NI35 1801 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 A0A087X1B8 175 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 A0A1W2PQ09 198 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 A0A1W2PRV1 198 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CLDN5O00501 218 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NRP1O14786 923 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CFLARO15519 480 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 HUS1O60921 280 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ACTL6BO94805 426 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MTHFD2P13995 350 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CSF2RAP15509 400 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TPH1P17752 444 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 AXLP30530 894 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ZNF81P51508 661 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NAGLUP54802 743 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 INHBCP55103 352 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 RAB10P61026 200 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PSME3P61289 254 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CYP4F8P98187 520 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CDC42EP1Q00587 391 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SULT2A1Q06520 285 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ZNF33AQ06730 810 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CDH17Q12864 832 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TRIM32Q13049 653 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NME3Q13232 169 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SPIDRQ14159 915 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SQLEQ14534 574 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MAPRE2Q15555 327 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PCID2Q5JVF3 399 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 REP15Q6BDI9 236 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 LINC00523Q86TU6 105 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 CARM1Q86X55 608 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ERO1BQ86YB8 467 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 LZICQ8WZA0 190 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MR1Q95460 341 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 FBXW5Q969U6 566 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NXNL1Q96CM4 212 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MOCOSQ96EN8 888 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 FAR2Q96K12 515 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MARK4Q96L34 752 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NPAS2Q99743 824 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 APOL2Q9BQE5 337 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 HAUS8Q9BT25 410 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TEX12Q9BXU0 123 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ABCG8Q9H221 673 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 BRD7Q9NPI1 651 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 ACSS2Q9NR19 701 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 GPR27Q9NS67 375 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 RNF186Q9NXI6 227 aa6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PFKFB4-210ENST00000468162 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms