RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 EBLN1P0CF75 366 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ELK4P28324 431 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 NUP107P57740 925 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 NEDD8Q15843 81 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GPR107Q5VW38 600 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 NXPE1Q8N323 547 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 H0Y858 1186 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 STK16O75716 305 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PRSS23O95084 383 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ALPLP05186 524 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 THRBP10828 461 aa20.04■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 EPHB3P54753 998 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZNB5 142 aa20.04■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.04■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 ING2Q9H160 280 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TLR9Q9NR96 1032 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.04■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 G3V2T6 193 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 B4GAT1O43505 415 aa20.03■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 GTDC1Q4AE62 458 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GPR26Q8NDV2 337 aa20.03■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 ACTR8Q9H981 624 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 INVSQ9Y283 1065 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GFRA2O00451 464 aa20.03■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 WDR47O94967 919 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MAPK8P45983 427 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 STT3AP46977 705 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 NKG7Q16617 165 aa20.03■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.03■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 ACDQ96AP0 544 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 HIPK3Q9H422 1215 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 C1orf109Q9NX04 203 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ARL15Q9NXU5 204 aa20.03■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GNGT2O14610 69 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 IGSF6O95976 241 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SERPINA4P29622 427 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SHMT2P34897 504 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 HLCSP50747 726 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LMAN2Q12907 356 aa20.02■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.02■□□□□ 0.8
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IMP4-208ENST00000460766 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TMEM169Q96HH4 297 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SH3GL1Q99961 368 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SMURF2Q9HAU4 748 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PREBQ9HCU5 417 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.02■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 CXCR6O00574 342 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 ATE1O95260 518 aa20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
IMP4-208ENST00000460766 BCKDHAP12694 445 aa20.01■□□□□ 0.79
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