RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH3A1P30838 453 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 GKN2Q86XP6 184 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.52■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf66Q96MD2 445 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRFN3Q9BTN0 628 aa16.52■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.52■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMX1AQ8TE12 382 aa16.51■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC138Q96M89 665 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EGFL8Q99944 293 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MECRQ9BV79 373 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN10Q9HC96 672 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL15Q9NXU5 204 aa16.51■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JNG1 304 aa16.51■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LMO7DNF2Z398 122 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 STX16O14662 325 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 YKT6O15498 198 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIAS2O75928 621 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAA20P61599 178 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GUCY1A3Q02108 690 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf61Q13536 156 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DS5Q14953 304 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPE65Q16518 533 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDK4Q16654 411 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFKFB4Q16877 469 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF423Q2M1K9 1284 aa16.51■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IYDQ6PHW0 289 aa16.51■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATL1Q8WXF7 558 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEB18Q96M61 343 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EML5Q05BV3 1969 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEMP2A6NFY4 417 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO1CO00159 1063 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLF11O14901 512 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM1AO60341 852 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GUCA1CO95843 209 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYPP08247 313 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 IMPDH1P20839 514 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRK2P25098 689 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 BDKRB1P46663 353 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GYS2P54840 703 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIK2Q13002 908 aa16.5■□□□□ 0.23
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