RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PKP3Q9Y446 797 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FCGR1AP12314 374 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BCKDHAP12694 445 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD12P35452 270 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN2CP42773 168 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RFX2P48378 723 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPKAPK2P49137 400 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PWP1Q13610 501 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GLYATQ6IB77 296 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT18Q6P9A2 607 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD11Q96NU1 681 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMP4Q99727 224 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LHX3Q9UBR4 397 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PADI3Q9ULW8 664 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GINS2Q9Y248 185 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CSADQ9Y600 493 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCM1Q15154 2024 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 THP07101 528 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKACGP22612 351 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGB7P26010 798 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FADDQ13158 208 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SULF1Q8IWU6 871 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM181AQ8N9Y4 354 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CORO1BQ9BR76 489 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACPTQ9BZG2 426 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SIK2Q9H0K1 926 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5MQ9NPB1 228 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD3Q9NPG1 666 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL26Q9NPH9 171 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN24A6NM45 220 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGA2P52926 109 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ8Q15842 424 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MPEG1Q2M385 716 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4L1Q8NH43 312 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MCOLN1Q9GZU1 580 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENONQ9NZV5 590 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KLQ9UEF7 1012 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SUN2Q9UH99 717 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NPC1O15118 1278 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR182O15218 404 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SCO2O43819 266 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX4O60224 188 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AOC2O75106 756 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX4O95219 450 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NAT16Q8N8M0 369 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HCSTQ9UBK5 93 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK5O95279 499 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACPPP15309 386 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SDC1P18827 310 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNA2P20248 432 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HMOX2P30519 316 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL18R1Q13478 541 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SDHAF4Q5VUM1 108 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL31Q6EBC2 164 aa3.55□□□□□ -1.84
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