RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 VPS4BO75351 444 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 MOCS3O95396 460 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 KRT7P08729 469 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 P4HA1P13674 534 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 GAP43P17677 238 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 HK1P19367 917 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 AKT2P31751 481 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 NUDT1P36639 197 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 NNMTP40261 264 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 SGSHP51688 502 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 NDST1P52848 882 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 METAP1P53582 386 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 PNLIPRP1P54315 467 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 MLLT10P55197 1068 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CLDN2P57739 230 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ACCSLQ4AC99 568 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 C9orf64Q5T6V5 341 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 MANEALQ5VSG8 457 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 SCD5Q86SK9 330 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 D2HGDHQ8N465 521 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRK-210ENST00000415055 PDPRQ8NCN5 879 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 POC1BQ8TC44 478 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 LMX1AQ8TE12 382 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 RNF139Q8WU17 664 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 AK8Q96MA6 479 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ETAA1Q9NY74 926 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 VPS4AQ9UN37 437 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 HPSEQ9Y251 543 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRK-210ENST00000415055 U3KQA8 63 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRK-210ENST00000415055 NF1P21359 2839 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 MYO7BQ6PIF6 2116 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-210ENST00000415055 HHLA1C9JL84 531 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 H0Y3Z8 333 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 PCDH17O14917 1159 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CLIC2O15247 247 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 AQP9O43315 295 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 DNPH1O43598 174 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 GIMD1P0DJR0 217 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 PRKAR1AP10644 381 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ITIH1P19827 911 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 GNLYP22749 145 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 SLC6A2P23975 617 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CNTFP26441 200 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 DRD3P35462 400 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 DCTP40126 519 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 UQCRFS1P47985 274 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ECT2LQ008S8 904 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CYP24A1Q07973 514 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CNTN1Q12860 1018 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 GPS1Q13098 491 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CDH18Q13634 790 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ALCAMQ13740 583 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZSR6 202 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM69Q86WT6 500 aa4.57□□□□□ -1.68
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