RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	CNTN5	O94779	1100 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	AHSG	P02765	367 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ACTR1B	P42025	376 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ATP4B	P51164	291 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ACTR1A	P61163	376 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	INA	Q16352	499 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	UBR7	Q8N806	425 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CDH22	Q9UJ99	828 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879		A8MT66	165 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	C4BPB	P20851	252 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	SPIB	Q01892	262 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	RTP2	Q5QGT7	225 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	LUZP2	Q86TE4	346 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF347	Q96SE7	839 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	OLFM1	Q99784	485 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CFL2	Q9Y281	166 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TIMM22	Q9Y584	194 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ECI2	O75521	394 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	SOX30	O94993	753 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	IFNW1	P05000	195 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	GPX6	P59796	221 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CSNK2B	P67870	215 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	NR4A3	Q92570	626 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CENPX	A8MT69	81 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PDPK1	O15530	556 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	LRAT	O95237	230 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TIE1	P35590	1138 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	NUDT1	P36639	197 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PWP1	Q13610	501 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10H3	O60404	316 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	KCNJ2	P63252	427 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	MTAP	Q13126	283 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	QPCT	Q16769	361 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ALG2	Q9H553	416 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CCL22	O00626	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	MPI	P34949	423 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	MAPK10	P53779	464 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TAS2R41	P59536	307 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	LIPE	Q05469	1076 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PTPRF-205	ENST00000414879	LIX1	Q8N485	282 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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