RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKD3O94806 890 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LAMP2P13473 410 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GLUD2P49448 558 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZBED5Q49AG3 693 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GPER1Q99527 375 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NFS1Q9Y697 457 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 HCRTO43612 131 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 HLA-DQB2P05538 268 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GPD2P43304 727 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ARFIP1P53367 373 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TWNKQ96RR1 684 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CCRL2O00421 344 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CCL16O15467 120 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DCDC1P59894 354 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CREB5Q02930 508 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC18A2Q05940 514 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNJ11Q14654 390 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC38A4Q969I6 547 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC115Q96NT0 180 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DLX3O60479 287 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SCGNO76038 276 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP11A1P05108 521 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CDH1P12830 882 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MEP1AQ16819 746 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MOCOSQ96EN8 888 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF31Q96EP0 1072 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNA7Q96RP8 456 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FETUBQ9UGM5 382 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ARL5CA6NH57 179 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 WWP2O00308 870 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKCHP24723 683 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RORCP51449 518 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBX18O95935 607 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IMPDH1P20839 514 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PLA2G16P53816 162 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 UFM1P61960 85 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DPYSL2Q16555 572 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CNTN3Q9P232 1028 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FANCGO15287 622 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PRODHO43272 600 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TFPIP10646 304 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CTNNB1P35222 781 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SMCO1Q147U7 214 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF366Q8N895 744 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 POLE4Q9NR33 117 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PADI3Q9ULW8 664 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GRM6O15303 877 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GLUD1P00367 558 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MYBPC3Q14896 1274 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TSC22D1Q15714 1073 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 UFD1Q92890 307 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DISP2A7MBM2 1401 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM159BA6NKW6 160 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ECI2O75521 394 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PSMD8P48556 350 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NFKB2Q00653 900 aa14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms