RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PLLPQ9Y342 182 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DEPDC5O75140 1603 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A1B0GVC2 190 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ST8SIA5O15466 376 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AP5Z1O43299 807 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RASAL1O95294 804 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GGT5P36269 586 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP4CP60510 307 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRP8Q14114 963 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TAF12Q16514 161 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHKBQ9Y259 395 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 M0QZ92 97 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCELO95171 688 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MLYCDO95822 493 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EPHA5P54756 1037 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCAND1P57086 179 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPARDQ03181 441 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNF151Q2KHN1 245 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CBWD3Q5JTY5 395 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC43A2Q8N370 569 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPOCK2Q92563 424 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C12orf57Q99622 126 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ALG2Q9H553 416 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNRF3Q9ULT6 936 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRRT4C9JH25 899 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP5D1E7EU14 171 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 M0R036 132 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GUCA1CO95843 209 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FTH1P02794 183 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IGFALSP35858 605 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HTR2BP41595 481 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCR4P51679 360 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLCNKAP51800 687 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 VSTM1Q6UX27 236 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM131BQ86XD5 332 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GIMD1P0DJR0 217 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GUCY1A2P33402 732 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SHMT1P34896 483 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OPRL1P41146 370 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CTSKP43235 329 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR10A3P58181 314 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERVK-9P63128 1117 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC17A1Q14916 467 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LLGL1Q15334 1064 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 STEAP4Q687X5 459 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAB12Q6IQ22 244 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FOXR1Q6PIV2 292 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMC8Q8IU68 726 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAXEQ8NCW5 288 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HTRA1Q92743 480 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYO19Q96H55 970 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLN6Q9NWW5 311 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 POLHQ9Y253 713 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CACNG2Q9Y698 323 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCN9AQ15858 1988 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A087X1B8 175 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LGALS8O00214 317 aa3.39□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AQP8O94778 261 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms