RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERVK_113Q902F9 699 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EGLN2Q96KS0 407 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL15Q96M94 604 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HARBI1Q96MB7 349 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GFI1Q99684 422 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OVOL2Q9BRP0 275 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLA2Q9H6Q3 261 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGIXQ9H6Y5 334 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 JPT2Q9H910 190 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAM22Q9P0K1 906 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABI3Q9P2A4 366 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL17BQ9UHF5 180 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FEM1BQ9UK73 627 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF175Q9Y473 711 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 B9A039 149 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 E7ENQ6 273 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 E9PI62 339 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PANO1I0J062 215 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP2K7O14733 419 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB43O43298 467 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3BGRLO75368 114 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKX2-2O95096 273 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RENP00797 406 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 VTNP04004 478 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-31P0DP07 118 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPD2P43304 727 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRELPP51888 382 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEK3P51956 506 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00315P59091 139 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G7Q13093 441 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SQLEQ14534 574 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MVPQ14764 893 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNIP1Q15025 636 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPECC1Q5M775 1068 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR45BQ5MNZ6 344 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC181Q5TID7 509 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6P435 159 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF534Q76KX8 674 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRM2BQ7LG56 351 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC190Q86UF4 302 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4N5Q8IXE1 308 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP38Q8NB14 1042 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RADILQ96JH8 1075 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGK494Q96LW2 274 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRB3Q9BUF7 120 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 STRA6Q9BX79 667 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HES7Q9BYE0 225 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHARPINQ9H0F6 387 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 THAP2Q9H0W7 228 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF9Q9HAQ2 790 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTN4Q9HB63 628 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASAH2Q9NR71 780 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYTL1Q9NRR1 136 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC5AQ9NY25 188 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6C2Q9NZP2 312 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCN3Q9P1Z3 774 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSF4Q9ULV5 492 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRCH1Q9Y2L9 728 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE10A6NGK3 116 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 J3QR06 171 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7ENM7 598 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OGTO15294 1046 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN3O60637 253 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 AVILO75366 819 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 JRKO75564 520 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEACAM4O75871 244 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCL10O95999 233 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASNSP08243 561 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM200BP0CF97 657 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 COX7A2P14406 83 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFAIP3P21580 790 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MDKP21741 143 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGRP47804 291 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP4BP51164 291 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 XGP55808 180 aa0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms