RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POMKQ9H5K3 350 aa6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDH7Q9ULB5 785 aa6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOTCH4Q99466 2003 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C5orf60A6NFR6 353 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITGA10O75578 1167 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GCATO75600 419 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRPP07492 148 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NR2F1P10589 423 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD70P32970 193 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PGM1P36871 562 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMP13P45452 471 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLCN7P51798 805 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRPSAP1Q14558 356 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF77Q15935 545 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARM1Q6UWI2 310 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APCDD1Q8J025 514 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BBS5Q8N3I7 341 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF480Q8WV37 535 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLCO2A1Q92959 643 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP2A3Q93084 1043 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf72Q96LT7 481 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOD2Q9HC29 1040 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DECR2Q9NUI1 292 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDE1Q9NZC3 331 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAD54BQ9Y620 910 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 F5P12259 2224 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ILVBLA1L0T0 632 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAM20O43506 726 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC4A1P02730 911 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HLA-DQB2P05538 268 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPH1P17752 444 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IVDP26440 423 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDI1P31150 447 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD86P42081 329 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRIA1P42261 906 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLE2P56282 527 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRADDP78560 199 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDSRQ06136 332 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMAN2Q12907 356 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHAF1BQ13112 559 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPP3Q13368 585 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC29A2Q14542 456 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MORF4L2Q15014 288 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KYNUQ16719 465 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMBQ6PCB8 327 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDIK1LQ8N165 341 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ART4Q93070 314 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MIEF2Q96C03 454 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFAP36Q96G28 342 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BTBD2Q9BX70 525 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE7BQ9NP56 450 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 K7ERQ8 282 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHHO43323 396 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIAS1O75925 651 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LATS1O95835 1130 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBL4AP11441 157 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF24P17028 368 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PFKLP17858 780 aa6.32□□□□□ -1.4
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