RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAIMQ9NVQ4 179 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NLGN3Q9NZ94 848 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PHF24Q9UPV7 400 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF12O95522 483 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 MYF6P23409 242 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CTSKP43235 329 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CD81P60033 236 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR2AG2A6NM03 316 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSPB2A8KAH6 182 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 COQ9O75208 318 aa4.83□□□□□ -1.64
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