RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 MC1RQ01726 317 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LCN10Q6JVE6 187 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 VRK3Q8IV63 474 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR4L1Q8NH43 312 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTL8Q9H568 366 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASF1AQ9Y294 204 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYO18BQ8IUG5 2567 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDC14CA4D256 554 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 GSTM1P09488 218 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 GSTM4Q03013 218 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LAMB3Q13751 1172 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CARFQ8N187 725 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR1L3Q8NH93 324 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCND1Q9NSA2 647 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCSK5Q92824 1860 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 K7EM74 188 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 HCRTR1O43613 425 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP104O60308 925 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CREG1O75629 220 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 MT-ND3P03897 115 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 NR1D1P20393 614 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCR7P32248 378 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TERF1P54274 439 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRAMEP78395 509 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYTL3Q4VX76 610 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 COLEC12Q5KU26 742 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT222Q8N1A0 295 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDYLQ9Y232 598 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF25-201ENST00000348333 MED13Q9UHV7 2174 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIPSLA2A3N6 862 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 C2orf74A8MZ97 194 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 MATN2O00339 956 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR56A5P0C7T3 313 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 NMBRP28336 390 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM69BQ5VUD6 431 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRELID2Q8N945 189 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 MR1Q95460 341 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHST8Q9H2A9 424 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM60AQ9NP50 221 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCND3Q9UK17 655 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 C21orf140B9A014 251 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 QSOX1O00391 747 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 UGT2B7P16662 529 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL10RAQ13651 578 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZIC1Q15915 447 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPESP1Q6UW49 350 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 CES3Q6UWW8 571 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 GSTA5Q7RTV2 222 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR5K2Q8NHB8 316 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR2A14Q96R47 310 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 TREX1Q9NSU2 369 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22■■□□□ 1.11
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms