RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF616Q08AN1 781 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 DCST1Q5T197 706 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ATG9BQ674R7 924 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RCN3Q96D15 328 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087X0B3 334 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 F5H0A9 414 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 IFNA5P01569 189 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CDH17Q12864 832 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MERTKQ12866 999 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 UBR7Q8N806 425 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC58Q96CX6 371 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TRBC1P01850 177 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HGFP14210 728 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 DGKAP23743 735 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PEX6Q13608 980 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MECRQ9BV79 373 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ABCG4Q9H172 646 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CPN2P22792 545 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SPOCK1Q08629 439 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXO32Q969P5 355 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 BRD9Q9H8M2 597 aa11.01□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0U1RQK1 487 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LAS2Q8IYD9 372 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NANSQ9NR45 359 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 VPS28Q9UK41 221 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB19A4D1S5 217 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MXE2 369 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SHOXO15266 292 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CHATP28329 748 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC6A9P48067 706 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HES5Q5TA89 166 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHL36Q8N4N3 616 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 REEP4Q9H6H4 257 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTL7BQ9Y614 415 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 UBR1Q8IWV7 1749 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LRATO95237 230 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LRP8Q14114 963 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF34Q8IZ26 560 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MED13Q9UHV7 2174 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC35F4A4IF30 521 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TUBAL3A6NHL2 446 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KBTBD13C9JR72 458 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PNPLA4P41247 253 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SEC23BQ15437 767 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TIGD2Q4W5G0 525 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 COX15Q7KZN9 410 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SPOCK2Q92563 424 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRNB1P11230 501 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RXRBP28702 533 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 BTBD2Q9BX70 525 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RHBGQ9H310 441 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NR2E1Q9Y466 385 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SERPINA4P29622 427 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HTD2P86397 168 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 DNASE1L2Q92874 299 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GAD1Q99259 594 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 DCSTAMPQ9H295 470 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FBRSQ9HAH7 460 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PLK2Q9NYY3 685 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 DCDC2BA2VCK2 349 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms