RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 IPPKQ9H8X2 491 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRNB1P11230 501 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TEAD1P28347 426 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSL1P33121 698 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 NFE2L1Q14494 772 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 RINLQ6ZS11 566 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2L2Q8NH16 312 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CATSPER2Q96P56 530 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 FZD3Q9NPG1 666 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 BTRCQ9Y297 605 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 K7EPI3 171 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFALSP35858 605 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A12P48065 614 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TPMTP51580 245 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF10Q13118 480 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBCCQ15814 346 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR26Q9H7D7 661 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 PREBQ9HCU5 417 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 OPTCQ9UBM4 332 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 EBF1Q9UH73 591 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BM21 787 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 STK16O75716 305 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT16P08779 473 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00032P0C843 101 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 UROSP10746 265 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 PKNOX1P55347 436 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 SGCGQ13326 291 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2H3Q13889 308 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KBTBD6Q86V97 674 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 PYCR2Q96C36 320 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 MGAT4DA6NG13 374 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 HIST1H2ADP20671 130 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2A7P20853 494 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN4P29074 926 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 BDKRB1P46663 353 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 AP1S2P56377 157 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 FZD5Q13467 585 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 NEK5Q6P3R8 708 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 FLCNQ8NFG4 579 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC3AQ02505 3323 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf142B7Z368 130 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC31A1O15431 190 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KATNA1O75449 491 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN1P07384 714 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 ACADLP28330 430 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 HNMTP50135 292 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 GAS6Q14393 721 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 XKR7Q5GH72 579 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2T11Q8NH01 316 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms