RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OR6C75A6NL08 312 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZBBXA8MT70 800 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 M0R129 80 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF4O60810 478 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 E2F6O75461 281 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RASAL1O95294 804 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CST1P01037 141 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ALBP02768 609 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NTRK1P04629 796 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 UGT2B4P06133 528 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 FMO3P31513 532 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HTR7P34969 479 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HSPA13P48723 471 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CCSMST1Q4G0I0 132 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HID1Q8IV36 788 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CHST14Q8NCH0 376 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OR2T12Q8NG77 320 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TANKQ92844 425 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 APOLD1Q96LR9 279 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ACTR8Q9H981 624 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ARL15Q9NXU5 204 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 YIPF1Q9Y548 306 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PRU2 124 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MATN4O95460 622 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PDYNP01213 254 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 EPOP01588 193 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRR35P0CG20 571 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SELPP16109 830 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CAPGP40121 348 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OCA2Q04671 838 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NFATC2Q13469 925 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LHX8Q68G74 356 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MAL2Q969L2 176 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 APIPQ96GX9 242 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CSF3RQ99062 836 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LRRC3Q9BY71 257 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DPY30Q9C005 99 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RASSF1Q9NS23 344 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 FAM234BA2RU67 622 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 AQP12BA6NM10 295 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RFXAPO00287 272 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD28O15084 1053 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D4O60343 1298 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SERPINA1P01009 418 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 FTH1P02794 183 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NUDT7P0C024 238 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MAP2K4P45985 399 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ARSFP54793 590 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RING1Q06587 406 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 VAC14Q08AM6 782 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 IER5LQ5T953 404 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LRRC66Q68CR7 880 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TRIM74Q86UV6 250 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GTF2H4Q92759 462 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 THAP11Q96EK4 314 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ACPTQ9BZG2 426 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LHPPQ9H008 270 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 P2RY12Q9H244 342 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OPTCQ9UBM4 332 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DHRS7Q9Y394 339 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ILVBLA1L0T0 632 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 INPPL1O15357 1258 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ULK1O75385 1050 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 INMTO95050 263 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms