RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 NDE1Q9NXR1 346 aa9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 OPTCQ9UBM4 332 aa9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GTL3 188 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL33A6NCF5 533 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ANTXRLA6NF34 631 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PLK4O00444 970 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT34O76011 436 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 OR4F21O95013 312 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V1G2O95670 118 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GUCA1CO95843 209 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 EBLN1P0CF75 366 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR89BP0CG08 455 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC6A12P48065 614 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPA7P48741 367 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GTF2H3Q13889 308 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SMU1Q2TAY7 513 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PNCKQ6P2M8 343 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C16orf89Q6UX73 402 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 LYPD8Q6UX82 237 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO27Q8NI29 283 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPEARQ8WU66 669 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ATL1Q8WXF7 558 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ASB12Q8WXK4 309 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ESAMQ96AP7 390 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM159Q96B96 161 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C3orf30Q96M34 536 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNA7Q96RP8 456 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC32A1Q9H598 525 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 IPPKQ9H8X2 491 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL15Q9NXU5 204 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 POLG2Q9UHN1 485 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SCML1Q9UN30 329 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 TRANK1O15050 2925 aa9.32□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLON5A6NGN9 336 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2AG2A6NM03 316 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 K7ESM1 405 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CHUKO15111 745 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 INPP4BO15327 924 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CATP04040 527 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPN1P07384 714 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 HGFP14210 728 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 IDO1P14902 403 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 EPB42P16452 691 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 ITGAXP20702 1163 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 WASP42768 502 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 CCNG1P51959 295 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 STX1BP61266 288 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MXRA7P84157 204 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDH1Q08174 1060 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 RPA4Q13156 261 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 STX5Q13190 355 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SNCBQ16143 134 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO43Q4G163 708 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 SYTL3Q4VX76 610 aa9.31□□□□□ -0.92
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms