RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228918.8

LTBR-201, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBR, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-201ENST00000228918 INHBBP09529 407 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 DGKAP23743 735 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TMBIM6P55061 237 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PPP2R2BQ00005 443 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 EPS8Q12929 822 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NFATC3Q12968 1075 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TTC23Q5W5X9 447 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SNX20Q7Z614 316 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TANKQ92844 425 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CLMPQ9H6B4 373 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 USE1Q9NZ43 259 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 KLQ9UEF7 1012 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.95■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ELOVL7A1L3X0 281 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 H0Y626 953 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CXCR6O00574 342 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 IL6P05231 212 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PGRP06401 933 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 IL7RP16871 459 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GNPDA1P46926 289 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NFATC2Q13469 925 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TUBA3CQ13748 450 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SVOPLQ8N434 492 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZBTB2Q8N680 514 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SNX19Q92543 992 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 BORCS5Q969J3 196 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ACDQ96AP0 544 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ASB8Q9H765 288 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ACTR8Q9H981 624 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MTRRQ9UBK8 725 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 VPS51Q9UID3 782 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 C2orf78A6NCI8 922 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TBL1XO60907 577 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NBNO60934 754 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ULK1O75385 1050 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SCELO95171 688 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TRIM16O95361 564 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 BMP1P13497 986 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CCNA2P20248 432 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 OR1D2P34982 312 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NRIP1P48552 1158 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 AP1S1P61966 158 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 BNIP3Q12983 259 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TTC16Q8NEE8 873 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SLC35B4Q969S0 331 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 FAM162AQ96A26 154 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 NTMT1Q9BV86 223 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 STOML2Q9UJZ1 356 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.94■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 K7EPI3 171 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SEC24AO95486 1093 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 EBLN1P0CF75 366 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ITGALP20701 1170 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ACRV1P26436 265 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 PIGAP37287 484 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 LAPTM5Q13571 262 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 IMPG1Q17R60 797 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 GTDC1Q4AE62 458 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 XKR5Q6UX68 686 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 MICU2Q8IYU8 434 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SGCDQ92629 289 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 ZIC5Q96T25 663 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SH3GL1Q99961 368 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.93■□□□□ 0.14
LTBR-201ENST00000228918 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms