RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202769.1

Trim54-202, Transcript of Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene Trim54, Length 1,408 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54-202ENSMUST00000202769 Anxa13Q99JG3 317 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sar1bQ9CQC9 198 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dusp12Q9D0T2 339 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 PaplnQ9EPX2 1280 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rabgef1Q9JM13 491 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 PrepQ9QUR6 710 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 Hey2Q9QUS4 339 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 Carm1Q9WVG6 608 aa16.02■□□□□ 0.16
Trim54-202ENSMUST00000202769 Skint1A7TZE6 364 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 B3galt1O54904 326 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Grap2O89100 322 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 RxraP28700 467 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 PpargP37238 505 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tnfsf9P41274 309 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 MipP51180 263 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pld2P97813 933 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Kcnd1Q03719 651 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Brinp2Q6DFY8 783 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm5414Q6IFZ8 552 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Doxl2Q6IMK7 723 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr384Q7TRX8 312 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 BivmQ8CBX9 502 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mettl22Q8R1C6 393 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr273Q8VG87 317 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rabl3Q9D4V7 236 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Aff4Q9ESC8 1160 aa16.02■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ahctf1Q8CJF7 2243 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fndc7A2AED3 737 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Xbp1O35426 267 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 ClppO88696 272 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tcn2O88968 430 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Slc9a3r1P70441 355 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Arntl2Q2VPD4 579 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Vps41Q5KU39 853 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 MelkQ61846 643 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 B3gnt5Q8BGY6 376 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Olfr1469Q8VFW5 309 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tti1Q91V83 1085 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mrgpra2Q91WW4 305 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 LiasQ99M04 373 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rexo2Q9D8S4 237 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Amdhd1Q9DBA8 426 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cts6Q9ET52 334 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cbll1Q9JIY2 491 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Padi4Q9Z183 666 aa16.01■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ep300B2RWS6 2412 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Golga4Q91VW5 2238 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mptx2D3YYJ7 219 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Capn5O08688 640 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 AurkcO88445 282 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 MutP16332 748 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Drc1Q3USS3 753 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mtus1Q5HZI1 1210 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 MogQ61885 246 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Mfsd4aQ6PDC8 510 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Scd4Q6T707 353 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Foxo6Q70KY4 559 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Sephs1Q8BH69 392 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Hmbox1Q8BJA3 419 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfp101Q8BP18 612 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfp57Q8C6P8 421 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Wipf1Q8K1I7 493 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Trim33Q99PP7 1142 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ddi1Q9DAF3 408 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Stpg4Q9DAG5 247 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Fbxo8Q9QZN3 319 aa16■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 PdynO35417 248 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zfpm1O35615 995 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Zw10O54692 779 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 ChkaO54804 453 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Top3aO70157 1003 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 InvsO89019 1062 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Krt10P02535 570 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Cntn1P12960 1020 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 MatkP41242 505 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 StarP51557 284 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 CxadrP97792 365 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Gm1123Q1RME4 390 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Ndufaf2Q59J78 168 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Lrp10Q7TQH7 713 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 TxlngQ8BHN1 524 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Klhl7Q8BUL5 586 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tcam1Q99NB3 548 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Trim54-202ENSMUST00000202769 Tmem186Q9CR76 216 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.8 ms