RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EpxP49290 716 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acot8P58137 320 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep295nlQ497N6 533 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfap20Q8BTU1 193 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco6c1Q8C0X7 706 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccm2Q8K2Y9 453 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1325Q8VF43 315 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk6Q91Y82 253 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gkn2Q9CQS6 184 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ampd2Q9DBT5 798 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex13aA2AFS9 377 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lipo4D3Z608 396 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifa1P97361 278 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema4aQ62178 760 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrtm4Q80XG9 590 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem198Q8BG75 360 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atg14Q8CDJ3 492 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Micu1Q8VCX5 477 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdia5Q921X9 517 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exo5Q9CXP9 373 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Insl5Q9WUG6 135 aa12.61□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arap2Q8BZ05 1703 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Suv39h1O54864 412 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C4bpaP08607 469 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccnd1P25322 295 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3UTZ3 580 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timm8a2Q4FZG7 97 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa17Q64016 82 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmcc2Q80W04 706 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chrnb3Q8BMN3 464 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tyw3Q8BSA9 257 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Enthd1E9Q1Z2 618 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9857F7CXR1 130 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r20L7N2B1 853 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ChadO55226 358 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Idh2P54071 452 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erp29P57759 262 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GscQ02591 256 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lix1Q6P566 282 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptx4Q6RUU0 478 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr384Q7TRX8 312 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vac14Q80WQ2 782 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plac9Q8K262 108 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smyd2Q8R5A0 433 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc3a1Q91WV7 685 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DcxrQ91X52 244 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prps2Q9CS42 318 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2010109A12RikQ9D875 119 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EqtnQ9D9V2 337 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actl7bQ9QY83 418 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tgm7A2ART8 616 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AU018091E9PWS4 684 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scg5P12961 212 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfsf9P41274 309 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AdslP54822 484 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Npy2rP97295 381 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb48Q1H9T6 681 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PeloQ80X73 385 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spns2Q91VM4 549 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TympQ99N42 471 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tomm70Q9CZW5 611 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Borcs5Q9D920 195 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cib4Q9D9N5 185 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pi16Q9ET66 489 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timp4Q9JHB3 224 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sppl2aQ9JJF9 523 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TesminQ9WTJ6 475 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa12.6□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elovl3O35949 271 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx3O70492 162 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prim2P33610 505 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps6P58064 125 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Six1Q62231 284 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam69bQ99ML4 431 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec1bQ9JL99 229 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5538W4VSP6 401 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itih4A6X935 942 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gp1baO35930 734 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akap3O88987 864 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lad1P57016 528 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NadkP58058 439 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr149Q3UVY1 732 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CltbQ6IRU5 229 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MregQ6NVG5 214 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Doc2aQ7TNF0 405 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfs1Q9Z1J3 459 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mbd4Q9Z2D7 554 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plce1Q8K4S1 2282 aa12.59□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Svs4P18419 113 aa12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.6 ms